隨著科研規模的快速擴大，目前學術期刊出現的問題之一是稿件數量急劇增加，而審稿專家人數和時間投入難以相配，因而篇均處理力度下降。我今天發言的目的是如何從論文品質內涵的視角提出應對的方法，尤其是在明確同行評議性質的基礎上，通過管理手段的改進，實現刊物品質的提升。
學術期刊品質的內涵是學術論文品質。那麼如何判別論文品質？刊物的品質是由每篇論文的品質綜合而成的，但論文不可能篇篇都是精品。在操作層面上，品質最好的文章就是哪些貢獻最大的論文。在所有論文中有重點地發現這些論文予以發表，是學術刊物的主要任務。從學術發展的角度考慮，論文遴選工作的目標是保證好論文的發表，而不是要設法淘汰所有品質差的論文。好的論文，最低層次是論文的格式符合要求寫作規範，最高層次則是在一個領域研究或方向上的“首發論文”。許多刊物都是由於發表這類論文而獲得聲譽的。以上兩者之間有許多過渡形態，構成一個連續譜。
從論文的不同類型來看，有兩類主要論文。一類是研究論文，它可以是刻畫特徵的，其品質要求是信息量，有高品質的資料，有進一步研究的潛力；或者可以是針對過程和機理的，產生新理論新觀點；也可以是關於研究方法的，提出觀測、分析和資料處理的新方法新技術。另一類是綜述論文，它可以是回顧一些重要方向的進展，其品質要求是準確描述最新進展和重要性，提出進一步研究的科學問題；也可以是針對現有知識體系的重新梳理，集成新知識，其品質要求是知識的系統性提升，以及今後研究方向的建議。因此，研究論文的共性是原創性，而綜述論文的共性是指明今後發展方向。在這些方面最突出的就是論文中的上品，需要編輯部下大力氣去培植。
在稿件過多的今天，不可能對每份稿件平均用力，應抓住一頭，放開一片，即對於一般性有價值的論文予以放行，而對於有精品潛力的論文，則要投入較多人力物力，使之在短時間內趨於完善並加快發表。較好的狀況是，每一期都有這樣的論文，使研究者們對新成果有所期待。
應對新情況，還要改進審稿過程。期刊的匿名審稿方式已經有了約300年歷史，請名家過目可以防止稿件出現明顯的錯誤，好的審稿報告還可以幫助作者提升論文的亮點。在科學發展歷史中，這一制度被逐漸固化，並推廣到專案評審的領域，如自然科學基金委員會的專案評審。但是，在評審物件和評審人數量都大幅度上升的情況下，這一制度並不天然地具有品質保障功能。在早年論文發表並不作為崗位考核指標的情況下，若非有發表學術見解的衝動，人們不會大量投稿。另一方面，在科學家人群中，名家畢竟是少數，他們的時間和精力也只夠處理少量稿件，否則他們自己也無法做研究了。所以早年的匿名審稿制會有較好的效果。現在就不同了，規模的增大使審稿過程變得十分複雜，審稿隊伍也擴大到廣大的科技人員，編輯部要面對如此之大的人群，而且往往是有利益相關和衝突的人群。科研與專案經費還事關職稱晉升和年度考核，審稿甚至確定審稿人的難度可想而知。
有些刊物為了保證公正，並充分利用審稿專家的資源，採用了審稿的雙盲方式，或規定了論文的篇幅，但這些措施即使可行，也不能真正保證論文的品質。還有的刊物採取固定審稿天數或錄用百分比的辦法，也不能適應論文投稿規模的動態變化，而且在刊物評價重視影響因數的情況下，這些措施的效果很可能是負面的。
對於如今匿名審稿的組織工作，一定要認識到，其可操作性取決於投稿規模和專家人數及願意投入的精力，對稿件進行分層次處理也許是有效的。編委會成員可對稿件的潛質提出評價建議，潛力大的論文經高層專家或名家審稿，以幫助其進一步提高。普通稿件則可降低專家的水準要求。但在這兩種情況下都要對審稿人提出要求，符合學術水準和誠信水準的審稿報告，應是正面鼓勵的、建設性的，有合理的具體修改建議，缺乏這寫要素的報告，是不合格的，應不予採納。由於利益衝突、觀點不一致而提出退稿建議，或者使作者難以修改而延誤發表，這樣的動機有時也可見到，此種行為是不正當的。我們注意到，較差的論文有兩種截然不同的類型，第一類是由於作者沒有花費很多勞動，內容空洞，退稿是正當的；第二類是作者投入大量勞動，內容具有原創性，品質上的問題通常是由於語文較差、邏輯不夠嚴密、圖表品質欠佳之類，對此種情況不應退稿。編委會要把好關，在作者和審稿者之間保持必要的平衡，對有價值的論文，儘量鼓勵作者修改，並通過稿件處理過程提高審稿人的操守和能力。